Browsing Student Essays / Biomedicinsk laboratorievetenskap by Issue Date

Now showing items 1-15 of 15

Jämförelse av diastoliska parametrar i liggande respektive sittande s...
Alsafi, Zahraa : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2010)	STUDENT ESSAY

English abstract:	COMPARISON OF DIASTOLIC PARAMETERS BETWEEN SUPINE POSTURE AND SITTING POSITION ZAHRAA ALSAFI Alsafi Z. Comparison of diastolic parameters between supine posture and sitting position. Degree Project, 15 Credit Points. Biomedical Laboratory Science, Malmö University: Health and Society, Department of Biomedical Laboratory Science, 2010. Changes in body position entails changes in cardiac diastolic function. Studies have shown that diastolic parameters are higher at supine posture in comparison with for example upright posture. The studies were made using non-invasive techniques performed by echocardiography. The change in the diastolic function arises because of variations in preload and filling pressures when changed body position. The purpose of this study was to measure the heart's diastolic parameters at supine posture and sitting position for a comparison. Pulsed doppler echocardiography and tissue doppler imaging were used to assess the diastolic parameters in 30 consecutive patients in the Cardiology clinic of Malmo, SUS. With pulsed doppler echocardiography the peak early mitral inflow velocity (E) and peak late filling velocity (A) were measured at the opening of mitral valve. An E/A ratio was calculated for all patients. On the contrary tissue doppler imaging was used to measure peak rate of early mitral annular velocity (E'). This value was measured at the septal and the lateral wall of the heart, and later an E'-average was calculated from these two measurements. With this value and the previously measured E-wave velocity, an E/É-ratio was calculated for all patients. Using t-test paired sample test a comparison between E/A ratio in supine posture and sitting position was made. A comparison was made in a similar way with the E/E'-ratio. Results from t-test for both E/A and E/E'-ratio gave a p-value >0.05. This result means that this study can not show a significant difference in the diastolic parameters at supine posture and sitting position. Key words: Body position, Diastolic dysfunction, Diastolic function, E/A ratio, E/É ratio, Filling pressure, Preload, Pulsed Doppler imaging, Respiration, Tissue Doppler imaging.
Swedish abstract:	JÄMFÖRELSE AV DIASTOLISKA PARAMETRAR I LIGGANDE RESPEKTIVE SITTANDE STÄLLNING ZAHRAA ALSAFI Alsafi Z. Jämförelse av diastoliska parametrar i liggande respektive sittande ställning. Examensarbete i i biomedicinsk laboratorievetenskap 15 högskolepoäng. Malmö högskola: Hälsa och samhälle, Utbildningsområde Biomedicinsk laboratorievetenskap, 2010. Ändringar av kroppsställning medför ändringar i hjärtats diastoliska funktion. Studier har visat med hjälp av icke-invasiva metoder utförda med ekokardiografi, att de diastoliska parametrarna är större vid liggande i jämförelse med exempelvis stående ställning. Denna ändring uppkommer på grund av ändringar i bland annat preload och fyllnadstryck vid ändringar i kroppsställning. Syftet med denna studie var att mäta hjärtats diastoliska parametrar vid liggande samt sittande ställning för jämförelse. Pulsad dopplerteknik och vävnadsdoppler teknik användes för att registrera de diastoliska parametrarna hos 30 konsekutiva patienter på Kardiologiska kliniken SUS Malmö. Med pulsad dopplerteknik registrerades E- och A-vågshastigheter vid mitralisklaffarnas öppning. En E/A-kvot beräknades för samtliga patienter. Vävnadsdoppler användes för att registrera É-vågshastigheten septalt samt lateralt och ett É-medelvärde räknades utifrån dessa två mätningar. Med detta värde samt den tidigare mätta E-vågshastigheten beräknades en E/É-kvot för samtliga patienter. Med hjälp av t-test för parvisa observationer gjordes en jämförelse av E/A-kvoten mellan liggande och sittande kroppsställning. På samma sätt jämfördes E/É-kvoten mellan liggande och sittande. Resultaten från t-testet för både E/A och E/É-kvoten gav ett p-värde > 0,05. Detta resultat innebär att ingen signifikant skillnad i de diastoliska parametrarna vid liggande och sittande kunde påvisas statistiskt i denna studie. Nyckelord: Diastolisk dysfunktion, Diastolisk funktion, E/A-kvot, E/É-kvot, Fyllnadstryck, Kroppsställning, Preload, Pulsaddoppler teknik, Respiration, Vävnadsdoppler teknik.

Examensarbete.pdf (346.8Kb)

Prokalcitonin som markör för sepsis och bakteriella infektioner. Utp...
Velin, Therese : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2010)	STUDENT ESSAY

English abstract:	Procalcitonin is a 116 amino acid prohormone, normally produced in the thyroid c-cells and in the neuroendocrine cells in the lungs, in response to hypercalcemia. In infections and sepsis bacterial lipopolysaccharides and different cytokines stimulate cells throughout the body to produce procalcitonin. Several trials have been carried out to evaluate how measurements of procalcitonin can be used, partly to separate bacterial infections from non-bacterial, and partly to guide individual treatment with antibiotics. In these studies the use of antibiotics could be reduced, reducing the risk of developing bacterial resistance and the cost of treatment. The purpose of this trial is to investigate a new method for procalcitonin assay. The method is an automated immunoassay on an existing instrument in the department of Clinical chemistry in Kristianstad. Blood specimens from the departments of Clinical chemistry in Lund, who uses the same method and Malmö, who uses another automated immunoassay, were compared to the present method. Good agreement was found between Kristianstad and Lund, while the relationship between Kristianstad and Malmö was slightly weaker. Precision between days was satisfactory, totalling 4,5 % on the low control and 1,9 % on the high control. Precision within series was excellent, 1,4 % on average.
Swedish abstract:	Prokalcitonin är ett prohormon på 116 aminosyror som normalt produceras i tyroideas c-celler och i neuroendokrina celler i lungorna som svar på hyperkalcemi. Vid sepsis och andra bakteriella infektioner stimulerar bakterielipopolysackarider (LPS) och olika cytokiner produktionen av prokalcitonin i celler i hela kroppen. Flera studier har gjorts för att utvärdera hur prokalcitoninmätningar kan användas, dels för att skilja bakteriella infektioner från icke-bakteriella, dels för att anpassa antibiotikabehandlingen individuellt. I dessa studier har antibiotikaanvändningen kunnat minskas, vilket kan leda till minskat selektivt tryck och minskad resistens hos bakterier, samt sänker kostnaden för behandling. Syftet med denna studie är att sätta upp en ny metod för prokalcitoninanalys. Metoden är en automatiserad, immunologisk metod på befintligt instrument i Kristianstad. Prover dels från Lund, som använder samma metod, dels från Malmö, som använder en annan automatiserad metod, jämfördes med mätningar på Kristianstads instrument. Resultatet visade god överensstämmelse mellan Kristianstads och Lunds mätningar och något sämre mellan Kristianstads och Malmös mätningar. Mellandagsprecisionen var tillfredsställande, totalt 4,5 % på den låga kontrollen och 1,9 % på den höga kontrollen. Inomserieprecisionen var utmärkt, 1,4 % i genomsnitt.

Examensarbete Prokalcitonin 2.pdf (179.2Kb)

Precisionsbestämning av bendensitometri
Karlsson, Karin; Mortensen, Nadja : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2010)	STUDENT ESSAY

English abstract:	It is recommended by the International Society for Clinical Densitometry (ISCD) that every clinic performs a precision assessment of bone densitometry to evaluate the reproducibility. Bone densitometry is used for diagnosis of osteoporosis, to monitor response to treatment and to assess patients’ risk of fractures. Dual energy x-ray absorptiometry (DXA) was used to perform double scans of patients already booked for examination at the section of clinical physiology, Skåne University Hospital (SUS), Lund. 105 patients were included in the study. Measurements were made at whole body, total hip, femoral neck and lumbar spine. The whole body scans were included in an interindividual study, whereas the others were included in intraindividual studies. The reproducibility was expressed as least significant change (LSC), root mean square standard deviation (RMS SD) and coefficient of variation (%CV). The reproducibility in the study was good, with low values for LSC and RMS SD. %CV fell below the maximal values recommended by the ISCD, which are 1,8 % for total hip, 2,5 % for femoral neck and 1,9 % for lumbar spine.
Swedish abstract:	International Society for Clinical Densitometry (ISCD) rekommenderar att precisionsbestämning av bentäthetsmätning görs på varje klinik för att bedöma reproducerbarheten. Bentäthetsmätning görs för att diagnosticera osteoporos, följa upp behandling och förutsäga frakturrisk. I studien användes Dual energy x-ray absorptiometry (DXA) för att utföra dubbla mätningar på redan inbokade patienter på klinisk fysiologi, Skånes Universitetssjukhus (SUS), Lund. 105 patienter ingick i studien. Mätningarna utfördes på helkropp, totalhöft, lårbenshals och ländrygg. Helkroppsmätningar ingick i en interindividuell studie och de övriga ingick i intraindividuella studier. Reproducerbarheten uttrycktes som minsta signifikanta skillnaden (LSC), root mean square standardavvikelse (RMS SD) och variationskoefficient (%CV). Reproducerbarheten i studien var god med låga värden för LSC och RMS SD. %CV understeg de av ISCD rekommenderade maxvärdena, vilka är 1,8 % för totalhöft, 2,5 % för lårbenshals och 1,9 % för ländrygg.

ExamensarbeteKarinNadja.pdf (703.0Kb)

Bioprocess development
Dinulovic, Daniel : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	The aim with this study was to examine the feasibility of culturing mammalian cells in microtiter format. Further, I have investigated the effect of dIGF-I and AE-IGF-I compared to hrIGF-I and insulin on proliferation of 293-F cells. The level of enhanced protein expression was also studied. An approach using microtiter plate cultivation was investigated for cell culture process development. The main hurdle to overcome with cell culture in microtiter format was the excessive liquid evaporation from the wells. Cell culture in microtiter plates is a process that could easily be automated and allow several experiments run at the same time. Meanwhile, it could offer considerable enhancements in experimental throughput, such as obtaining key process data much quicker and eliminate waste and costs in early stage process development. I have demonstrated that dIGF-I is capable of supporting the production of recombinant proteins from 293-F cells in serum-free cultures, at concentrations 400 and 100-fold lower than required for insulin. Even AE-IGF-I stimulated protein production greater than insulin, at 20- fold lower concentrations. The IGF-I variants demonstrated also equivalent or better performance than insulin and hr-IGF-I when it came to cell proliferation and culture longevity and are highly potent and effective alternatives. More research is needed to reach a clearer understanding of the potentiality of dIGF-I and AE-IGF-I as growth factors. This study should encourage further research into the potential of cultivation in shaken microplate format with addition of growth factors to improve protein production and cell proliferation.
Swedish abstract:	Syftet med denna studie var att undersöka möjligheten av att odla mammalieceller in mikrotiter format. Vidare har jag undersökt effekten av dIGF-I och AE-IGF-I i förhållande till hrIGF-I och insulin om proliferation av 293-F celler. Nivån av förbättrat proteinuttryck har också studerats. En ansats med odling i mikrotiterplatta undersöktes för bioprocessutveckling. Det största hindret med att odla i mikrotiter format var den alltför stora vätskeavdunstning från brunnarna. Cellodling i mikrotiterplattor är en process som lätt skulle kunna automatiseras och möjliggöra att flera experiment görs samtidigt. Samtidigt skulle det erbjuda betydande förbättringar i experimental genomströmning, såsom att få viktig nyckel data mycket snabbare och eliminera slöseri och kostnader i ett tidigt skede processutveckling. Resultaten visar att dIGF-jag har kapacitet att främja produktion av rekombinanta proteiner från 293-F celler i serumfria kulturer, i koncentrationer 400 och 100 gånger lägre än vad som krävs av insulin. Även AEIGF- I stimulerade proteinproduktion bättre än insulin, vid 20-faldigt lägre koncentrationer. IGF-I varianterna visade även likvärdig eller bättre prestanda än insulin när det gäller celltillväxt och viabilitet och är mycket potenta och effektiva alternativ. Fler experiment hade behövt göras för att få en bättre förståelse för dIGF-I och AE-IGF-I om deras potential som tillväxtfaktorer. Denna studie bör uppmuntra till ytterligare forskning om potentialiteten av mammaliecells odling i mikrotiter format med tillsättning av tillväxtfaktorer för bättre proteinproduktion och cellprolifiering.

Exjobb Daniel Dinulovic final+logga[1].pdf (658.0Kb)

Identifiering av 13 nya mjölksyrabakterier med DHPLC
Livaja, Ruzica : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	STUDENT ESSAY

English abstract:	Lactic acid bacteria belonging to genera Lactobacillus and Bifidobacterium has been recently discovered in bees and the honey they produce, and includes 13 new species [1]. Researchers are working to develop new rapid and more reliable detection methods to characterize these bacteria. In this project we investigate the possibility of identifying these bacteria with a new method called denaturing high performance liquid chromatography, DHPLC. The method involves the separation of the PCR (polymerase chain reaction) amplified 16S rDNA fragments in the DHPLC [8]. For the identification of bacteria various variable regions of 16S rRNA gene was amplified, sequencing proved great genetic variability between these bacteria [1]. Separation is effected by means of ion-pair reverse-phase high pressure liquid chromatography (IP RP HPLC) with partial denaturation of the DNA molecule. Previous studies of the identification of marine bacteria by DHPLC resulted in optimal separation [9]. Identification of the following lactic acid bacteria was verified to some limited degree. Analysis of the DHPLC demonstrated profiles with distinguishable peaks that represented the separation at the species level, that only between two bacteria of the genus Lactobacillus. Despite numerous adjustments of operating conditions such as existing column temperature and eluent buffer, did not result in separation of all 13 species. The analysis may have been influenced by a variety of malfunctions in the HPLC system and improper sample preparation. The method could possibly be improved if time was not a limitation.
Swedish abstract:	Mjölksyrabakterier tillhörande släkten Lactobacillus och Bifidobacterium har nyligen upptäckts hos bin och i honungen de producerar och innefattar 13 nya arter[1]. Forskarna arbetar med att ta fram nya snabba och mer pålitliga identifierings metoder för att karakterisera dessa bakterier. I detta projekt undersöktes möjligheten att identifiera dessa bakterier med en ny metod som heter denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC). Metoden bygger på separation av PCR (polymerase chain reaction) amplifierade 16S rDNA fragment i DHPLC [8]. Vid identifiering av bakterier amplifierades olika variabla regioner från 16S rRNA genen, som påvisade efter sekvensering störst genetisk variation mellan dessa bakterier [1]. Separationen utfördes med ion-pair reverse-phase high presure liquid chromatoghaphy (IP RP HPLC) med delvis denaturering av DNA molekylen. Tidigare studier av identifiering av marina bakterier med DHPLC resulterade i optimal separation [9]. Identifiering av följande mjölksyrabakterier kunde verifieras till en viss grad. Analys i DHPLC visade profiler med urskiljbara toppar som utgjorde separation på artnivå, detta enbart mellan två bakterier tillhörande släktet Lactobacillus. Trots olika justeringar av analys parametrar gällande kolonntemperatur och elueringsbuffert, erhölls inte separation mellan alla 13 arter. Analysen kan ha påverkats av en rad olika funktionsfel i HPLC systemet och felaktig beredning av prov. Metoden kunde eventuellt förbättrats om tiden inte varit en begränsning.

Examensarbete 03-2011 (16) 110605.pdf (811.4Kb)

Utveckling av en PCR metod för identifiering av nyupptäckta mjölksyra...
Celander, Maria : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Several different lactic acid bacterium (LAB) species from the genera Lactobacillus and Bifidobacterium was discovered in bees and in their honey. Today there is no rapid and reliable method to identify these LAB. Therefore a rapid polymerase chain reaction (PCR) method to identify the LAB is needed. The aim of this project is to find primers suitable for the different LAB. Ribosomal ribonucleic acid (rRNA) genes or 16S-23S rRNA intergenic spacer region (ISR) are often used to designing of primers followed by PCR assays, for identification of different bacteria. To visualize deoxyribonucleic acid (DNA) in agarose gels, SYBRgreen I was used as fluorescence and then viewed under ultraviolet (UV) light. In this project the 16S rRNA and 16S-23S rRNA ISR was used as a target in a PCR and a multiplex PCR amplification. The PCR product was analyzed in agarose gel in an attempt to identify the LAB. 16S rRNA sequence have to little variation and is not suitable to identify closely related species. 16S-23S rRNA ISR sequence exhibits greater variations, especially between Lactobacillus and Bifidobacterium. Differentiation of the bacteria into groups by multiplex PCR was done with good result, except for some of the bacteria that did not end up in the expected group. More studys is needed to support these results.
Swedish abstract:	Flera olika arter av mjölksyrabakterier som ingår i släktena Lactobacillus och Bifidobacterium har hittats hos bin och i deras honung. Idag finns ingen effektiv metod för identifiering av bakterierna. Syftet med detta projekt är att utveckla en metod för snabb identifiering genom att hitta lämpliga primers till olika mjölksyrabakterier och därmed få fram en Polymeraskedjereaktion (PCR) metod. Ribosomal ribonukleinsyra (rRNA) generna eller 16S-23S rRNA intergenic spacer region (ISR) används ofta vid design av primers, som därefter används i PCR för att identifiera olika bakterier. Deoxiribonukleinsyra (DNA) visualiseras i agarosgelen med hjälp av SYBRgreen I som fluorescens på ultraviolett (UV)-ljusbord. I detta projekt har 16S rRNA och 16S-23S rRNA ISR amplifierats i enkel PCR och multiplex PCR och visualiserats i agarosgel i försök att identifiera mjölksyrabakterierna. 16S rRNA har visat sig ha mycket liten variation mellan bakterierna och ansågs därför inte lämplig att använda för identifiering av närbesläktade arter. 16S-23S rRNA ISR visade större variation, fram för allt mellan lactobacillerna och bifidobakterierna. Gruppering av bakterierna med hjälp av multiplex PCR gjordes med viss framgång, med undantag av några bakterier som inte hamnade i den förväntade gruppen. Dock behövs fler försök för att stödja dessa resultat.

Examens.lacto.pdf (421.9Kb)

Förbättrar "ST/HR-loopar" bedömning av ischemi vid arbets-EKG hos kvi...
Al-Mashat, Mariam; Akil, Shahnaz : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Exercise induced myocardial ischemia can be diagnosed with exercise–ECG, mainly through the parameter ST60-depression during the exercise and recovery phases. However, its low diagnostic accuracy, especially in women, has been proven. An adjustment of the ST60-depression with the heart rate has been done in several studies to develop the diagnosis. When the heart rate is plotted against the ST60-depression, an ST/HR- loop is obtained where both the exercise and recovery phases are included. The normalised area (NA) of the loop is believed to be significant for the diagnosis of ischemia. The aim of the study is to decide if the diagnosis of ischemia in women can be improved with the normalised area of the loop, from exercise– ECG, compared to the conventional assessment with ST60-depression at the end of exercise. Myocardial scintigraphy (the reference method) and exercise- ECG have been performed at the department of clinical physiology in Lund. The control group included 80 women with a normal myocardial scintigraphy while the other group consists of 26 patients who, according to their myocardial scintigraphy, have exercise induced myocardial ischemia. A distinction between the groups could not be made with the normalised area. The conventional assessment with ST60-depression was not better than the normalised area for the assessment of myocardial ischemia. Key words: Exercise- ECG, myocardial ischemia, myocardial scintigraphy, normalised area, ST60- depression, ST/HR-loop.
Swedish abstract:	Arbetsutlöst myokardischemi kan diagnostiseras med arbetsprovet, främst genom parametern ST60-sänkning under arbete samt återhämtningsfasen. Tidigare studier har visat arbetsprovets låga diagnostiska förmåga av arbetsutlöst myokardischemi och klassificerat det som en osäker metod, speciellt för kvinnor, och få studier har gjorts på kvinnor för förbättring. En justering av ST60-sänkning med hänsyn till hjärtfrekvensen (HR) har gjorts i flera studier, i försök att utveckla diagnostiken. När hjärtfrekvensen ritas grafiskt mot ST60- sänkning erhålls en ST/HR loop bestående av arbetsfasen och återhämtningsfasen. Den normaliserade arean (NA), som erhålls från ST/HR- loopen, är ett mått på sannolikheten för ischemi och dess grad. Studiens syfte är att, utifrån ST/HR loopars NA-värden från arbetselektrokardiogram, avgöra om diagnostiken av ischemi hos kvinnor kan förbättras i jämförelse med den konventionella bedömningen som baseras på ST60-sänkningen i slutet av arbete. Myokardscintigrafi (facitmetoden) och arbetsprov har utförts på den klinisk fysiologiska avdelningen i lund. Kontrollgruppen bestod av 80 kvinnor med normal myokardscintigrafi medan gruppen ”sjuka” omfattar 26 patienter som med myokardscintigrafi bedömts ha arbetsutlöst myokardischemi. För att i denna studie påvisa om det föreligger en statistisk skillnad mellan sjuka och friska, gällande NA – värdet respektive ST60-sänkningen, användes t-testet. En skillnad mellan sjuka och friska med NA- värde kunde inte påvisas och den konventionella bedömningen med ST60-sänkning visade sig inte heller vara bättre än NA-värdet för bedömning av arbetsutlöst myokardischemi. Nyckelord: arbets- EKG, myokardischemi, myokardscintigrafi, normaliserad area, ST60- sänkning, ST/HR- loop.

Examensarbete.pdf (501.9Kb)

UTSÖNDRING AV STEN-BILDANDE SUBSTANSER I URIN – KAN STICKPROV ERSÄTTA...
Majstorovic, Zoran : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Majstorović, Z. Secretion of stone-forming substances in the urine - can spot urine sample replace 24 hour urine collection? Degree project in Biomedical Laboratory Science, 15 credits points. Malmö University, Health and Society, Department of Biomedical Laboratory Science, 2011. Objective. Clinical investigation of kidney stone patients always includes moni-toring of the secretion of stone-forming substances in the urine. However, 24 h urine collection is difficult for the patient and prone to error. The purpose of this study is to examine whether there are alternatives to the collecting of urine under the period of 24 hours in cases where the secretion of stone-forming substances is constant across days. The question is whether the excretion of stone-forming sub-stances can be estimated by relating the concentration of urine to the creatinine concentration of urine, since the excretion of creatinine is relatively constant over a day. If so, the concentration of stone-forming substances in urine could be relat-ed to the concentration of creatinine in urine in the same way as drug analyses commonly are. Method. The subjects collected a 24h collection of urine. The first urine portion was stored in a container, while all subsequent urine was collected in a separate container. After about a week, another timed collection of urine was performed, but this time only in one container. The 24 h solute excretions were compared to each other and to the solute creatinine index. Results. A strong cor-relation was found between the creatinine index of calcium and the 24 h excretion of calcium. A somewhat weaker correlation was found for magnesium and a lack of correlation for phosphate and potassium. Conclusion. Results indicate that creatinine indexes in general do not predict 24 h excretions. However, creatinine index appears to predict the excretion of calcium and, to some extent, magnesium.
Swedish abstract:	Majstorović, Z. Utsöndring av stenbildande substanser i urin – kan stickprov er-sätta dygnsmängder? Examensarbete i Biomedicinsk laboratorievetenskap 15 högskolepoäng. Malmö högskola: Hälsa och samhälle, Utbildningsområde Bio-medicinsk laboratorievetenskap, 2011. Syfte. Utredning av njurstenspatienter omfattar alltid undersökning av utsönd-ringen av stenbildande substanser i urin. Samlingen av urin under ett dygn hos njurstenpatienter innebär ofta problem för patienten eftersom det inte är så sällan att de glömmer samla urin i dunken eller samlar för lång eller kort tid. Syftet med min undersökning är att undersöka om det finns alternativ till att samla urin under 24 timmar i de fall där utsöndringen av stenbildande substanser är konstant över dygnet. Frågeställningen är om utsöndringen av stenbildande substanser kan upp-skattas genom att relatera deras koncentration i urin till koncentrationen av kreati-nin i urin eftersom utsöndringen av kreatinin är relativt konstant över dygnet. I så fall bör koncentrationen av stenbildande substanser i urin kunna relateras till kon-centrationen av kreatinin i urin på samma sätt som vid narkotikaanalys. Metod. Försökspersonerna samlade all urin i exakt 24 timmar. Den första urinportionen sparades i ett separat kärl medan all efterföljande urin samlades i en separat dunk . Efter ca en vecka gjordes en ny urinsamling, denna gång bara i en dunk. Dygnsut-söndringarna jämfördes med varandra och med kreatininindex i stickprovet. Re-sultat. Ett starkt samband fanns mellan kreatininindex av kalcium och dygnut-söndringen av kalcium. Sambandet var något mindre starkt för magnesium och saknades för fosfat och kalium. Slutsats. Resultaten talar mot att kreatininindex generellt kan användas för att skatta utsöndringen av njurstensbildande substanser. Däremot verkar kreatininindex relativt väl förutsäga utsöndringen av kalcium och i viss mån även magnesium.

Examensarbete av Zoran Majstorovic.pdf (570.5Kb)

Jämförelse mellan kvinnor och mäns överlevnad baserad på resultat frå...
MIRBAZEL, SEYEDEH HOURIEH : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Mirbazel SH. Comparison between men and women’s survival based on the results from the exercise tests and myocardial perfusion imaging. Degree Project in Biomedical Laboratory Science, 15 points. Malmö University: Health and Society, Department of Biomedical Laboratory Science, 2011. One of the most common causes of death in both developing countries and in the Western world is heart attack that hits usually individuals over 65 years. Cardiac ischemia is the most common cause of myocardial infarction/sudden cardiac arrest. For the diagnosis of cardiac ischemia, exercise test is the first choice, because the method is inexpensive, non-invasive and relatively harmless. Myocardial perfusion imaging is often performed after an inconclusive exercise test. The purpose of this retrospective study was to determine if the prognosis and survival differ between women and men depending on the outcome of the investigation from the exercise test, and the myocardial perfusion imaging. In this study 2045 patients were analyzed who were registered to perform the exercise tests for a suspected or previously known coronary artery disease in 2006/2007. Patient’s results were divided into three groups: normal, pathological and intermediate findings. The intermediary group was further divided according to results of myocardial perfusion imaging within 6 months of the exercise test: those with normal, those with pathologic and those who had not carried out any myocardial perfusion imaging. Patients with normal exercise test were 1110, with intermediate exercise test 540 and with pathologic exercise test were 254 people. There are statistically significant differences in the number of living and deceased between men and women in intermediate exercise tests (p < 0, 001) and in the subgroup, intermediary without myocardial perfusion imaging (p < 0,001). There is also a statistically significant difference in survival in the main group with the intermediate exercise tests (p < 0.01). No analysis was performed for sub-groups. In conclusion, this study has shown that there are no statistically significant differences in survival between men and women with normal and pathological exercise test. However there is a significant difference in intermediary group.
Swedish abstract:	Mirbazel SH. Jämförelse mellan kvinnor och mäns överlevnad baserad på resultat från arbetsprov och myokardscintigrafi. Examensarbete i Biomedicinsk Laboratorievetenskap, 15 högskolepoäng. Malmö högskola: Hälsa och Samhälle, utbildningsområde för Biomedicinsk Laboratorievetenskap, 2011. En av de vanligaste orsakerna till död både i utvecklingsländerna och i västvärlden är hjärtinfarkt som drabbar vanligtvis individer över 65 år. Hjärtischemi är den vanligaste orsaken till hjärtinfarkt/ plötsligt hjärtstopp. För diagnostik av hjärtischemi används oftast arbetsprov som förstahandsval, eftersom metoden är billig, icke-invasiv och relativt ofarlig. Myokardscintigrafi utförs ofta efter arbetsprovet, om detta varit inkonklusivt. Syftet i denna retrospektiva studie var att ta reda på om prognosen och överlevnaden skiljer sig åt mellan kvinnor och män beroende på undersökningsresultat från arbetsprov och myokardscintigrafi. I denna studie analyserades 2045 patienter som var registrerade att utföra arbetsprov för misstänkt eller tidigare känd koronarkärlssjukdom under 2006 & 2007. Patienternas resultat delades i tre grupper: normalt, patologiskt och intermediärt enligt bestämda kriterier. Intermediärgruppen analyserades också om de hade utfört ett myokardscintigrafi inom 6 månader. Intermediärgruppen delades därefter in i tre grupper: de med normal myokardscintigrafi, de med patologisk och de som inte hade utfört någon. Patienter med normalt arbetsprov var 1110, med intermediärt arbetsprov 540 och med patologiskt arbetsprov 254 personer. Det finns statistiskt signifikanta skillnader av antal levande och avlidna mellan män och kvinnor i intermediärt arbetsprov (p < 0,001) och i undergruppen, intermediär utan utförd myokardscintigrafi (p < 0,001). Det finns också en statistiskt signifikant skillnad i överlevnad i huvudgruppen med intermediärt arbetsprov(p < 0,01). Inga analyser av överlevad utfördes för undergrupperna. Sammanfattningsvis har denna studie visat att det inte finns några statistiskt säkerställda skillnader i överlevnad mellan män och kvinnor med normalt och patologiskt arbetsprov däremot finns det en signifikant skillnad i intermediärgruppen.

examarbete 2011doc.pdf (518.1Kb)

Betydelsen av interleukin 4 receptorn (IL-4R) i stimulering av lymfom...
Skog, Emma : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Cytokines or interleukins are signal peptides of low molecular weight, which regulates many important functions. They can roughly be divided into two groups or divisions due to their effect on cells. Interleukin 4 (IL-4), for example, belongs to the group growth factors while interleukin-6 (IL-6) belongs to the group activation or differentiation factors. IgM receptors or B cell receptors, BCR, are expressed on B cells and are membrane-bound immunoglobulins (mIg) and have two main functions: to convey signals that control B cell activation and to bind antigen which will then be presented to T cells. In the study B cells were activated with antibodies against IgM (anti-IgM) and recombinant IL-4. After stimulation the IL-6 production was analysed by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The purpose of this study was to characterize the expression of IL-4 receptor in lymphoma and leukemia cells by flow cytometry and polymerase chain reaction (PCR) and furthermore the production of IL-6 by ELISA. ELISA analysis showed that two cell lines, stimulated Sp53 and stimulated and control of WaC3CD5+, resulted in an increased IL-6 production. When comparing ELISA results and flow cytometry assays, it can be seen that WaC3CD5+, which produced large amounts of IL-6, has a small percentage of IL-4 receptors on the cell surface. The results of the PCR analysis shows that particularly Sp53 displayed high amounts of IL-4 mRNA, but also I83, U2932 and WaC3CD5+ were positive for IL-4 mRNA. The results of this study are preliminary, and to get more trustworthy results, all analyses have to be repeated to get more reliable results.
Swedish abstract:	Cytokiner eller interleukiner är signalpeptider med låg molekylär vikt som reglerar många viktiga funktioner. De kan delas in i två grupper beroende på deras effekt på celler. Interleukin 4 (IL-4) till exempel kan tillhöra gruppen tillväxtfaktorer medan interleukin 6 (IL-6) kan tillhöra gruppen aktiverings- eller differentieringsfaktorer. IgM-receptorn eller B-cellsreceptorn, BCR, finns på Bceller och är membranbundna immunoglobuliner (mIg) som har två huvuduppgifter; att förmedla signaler som styr B-cellens utveckling samt att binda in antigen som sedan ska presenteras för T-celler. I studien aktiverades B-celler med antikropp mot IgM (anti-IgM) samt rekombinant IL-4. Efter stimulering analyserades IL-6 produktionen med enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Syftet med studien var att karakterisera uttrycket av IL-4 receptorn på lymfom- och leukemiceller med flödescytometri och polymeras chain reaction (PCR) samt produktion av IL-6 med ELISA. ELISA-analysen visade att två cellinjer, stimulerade Sp53 och stimulerade samt kontroller av WaC3CD5+, gav en ökning av IL-6 produktionen. Vid jämförelse med ELISA-resultaten och flödescytometri-analyserna ser man att WaC3CD5+ som producerat stora mängder IL-6, har en liten andel IL-4 receptorer på cellytan. Resultatet av PCRanalysen visar att det var framförallt Sp53 som fick höga mängder IL-4R mRNA, men även I83, U2932 och WaC3CD5+ fick positiva resultat. Resultaten i denna studie är preliminära och för att få mer säkerställda resultat krävs att alla analyser görs om ett antal gånger för att få ett mer tillförlitligt resultat.

BETYDELSEN AV I ... 4 RECEPTORN, EMMA SKOG.pdf (757.1Kb)

Utvärdering av felmeddelande i eMM Software Version 00-06 till Sysmex...
Abrahamsson, Elina : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2011)	STUDENT ESSAY

English abstract:	Sysmex XE-5000 is an automated cell counter that performs measurements with different principles. The two applied in this project are RF/DC (Radio Frequency/Direct Current) and Flow cytometry with semiconductor laser. RF/DC is based on changes in radio frequency resistance and direct current voltage. Changes in RF provide information about the density of the cell’s internal structure (e.g. the nucleus) and changes in DC provide information about the size of the blood cells. Flow Cytometry define as physiological and chemical properties of the cell. Detection of cells is achieved by the irradiation with a laser beam while passing through one by one. The information obtained from flow cytometry includes scattered light and fluorescence. Sysmex XE-5000 works with several different error messages, so-called alarm. One or more alarm indicates that there is an increased risk for the presence of abnormal cells and this can only be ruled out by a manual differential count. In this study three alarms, which indicate the presence of abnormal white blood cells, were analyzed: “Blasts?”, Atypical Lympho?” and “Abn Lympho/L_Blasts?”. The project aims to compare the current calculations with the new software (eMM) for the alarms and evaluate if they provide a smaller number of false positive alarms from the hematology instrument Sysmex XE-5000. Samples with one or two of the alarms were selected and analyzed with the current settings and then with the new settings for eMM. The result showed that the number of false-positive samples was reduced and that the number of duplicate alarms decreased.
Swedish abstract:	Sysmex XE-5000 är en automatiserad cellräknare som utför mätningar enligt olika mätprinciper, de två som tillämpats i projektet är RF/DC(Radio Frequency/Direct Current) samt Flödescytometri med halvledarlaser. RF/DC bygger på förändringar i radiofrekventa resistansen och likspänningsresistansen. Förändringar i den radiofrekventa resistansen (RF) ger information om densiteten i cellernas inre (exempelvis kärnans storlek) och förändringar i likspänningsresistensen (DC) ger information om blodcellernas storlek. Flödescytometri definierar ett mått på cellers fysiologiska och kemiska egenskaper. Detektion av cellerna sker genom att de bestrålas med en laserstråle samtidigt som de passerar en och en i instrumentet. Informationen som fås ut från flödescytometri inkluderar spritt ljus och fluorescens. Sysmex XE-5000 arbetar med flera olika felmeddelanden, så kallade larm. Ett eller flera larm indikerar att det finns en ökad risk för förekomst av abnormala celler och kan enbart uteslutas genom en manuell differentialräkning. I studien har tre larm, vilka indikerar närvaron av onormala leukocyter, undersökts: ”Blasts?”, ”Atypical Lympho?” och ”Abn Lympho/L_Blasts?”. Syftet med projektet är att jämföra nuvarande beräkningar med en ny mjukvara (eMM) för larmen och utvärdera om de ger ett mindre antal falskt positiva larm från hematologiinstrumentet Sysmex XE-5000. Prover med något av ovanstående larm valdes ut och analyserades först med nuvarande inställningar på instrumentet och därefter med de nya beräkningarna för eMM. Resultatet visar på att antalet falskt positiva prover minskar och även att antalet dubblettlarm minskar.

Utvärdering av ... ElinaAbrahamsson Final.pdf (1.927Mb)

Prognostisk signifikans av SATB1 och SATB2 uttryck i kolorektal cancer
Taratniya, Eshragh : Malmö högskola/Kultur och samhälle (2012)	STUDENT ESSAY

English abstract:	Colorectal cancer (CRC) is one of the most common cancers in the world with about 1 million new cases annually. Special AT-rich sequence binding protein 1 (SATB1), is a cell type specific nuclear matrix associated DNA binding protein, which consists of AT-rich DNA sequences. It has previously been demonstrated that another member in SATB-family, SATB2, is expressed in a tissue-specific manner in normal mucosa in the lower gastrointestinal tract and in CRC. β-catenin is an intracellular mediator of the Wnt/ β-catenin signaling pathway and plays an important role in colorectal carcinogenesis. Expression of SATB1, SATB2 and β-catenin was analyzed in tissue microarrays with tumors from 270 CRC patients. Spearman´s correlation test was used to assess the correlations and the impact of SATB1 and SATB2 on recurrence free survival was assessed by Kaplan-Meier analysis and log-rank test. The result of immunohistochemical staining shows that there is a correlation between the analyzed markers and that SATB1 expression is a poor prognostic factor in tumors expressing low levels of SATB2.
Swedish abstract:	Kolorektal cancer (CRC) är en av de vanligaste cancersjukdomarna i världen med cirka 1 miljon nya detekterade fall per år. Special AT-rich sequence-binding protein1 (SATB1) är ett celltyp-specifikt kärnmatrix-associerat DNA-bindande protein, vilket utgörs av AT-rika DNA sekvenser. Det har tidigare demonstrerats att en annan medlem i SATB-familjen, SATB2, uttrycks på ett vävnadsspecifikt sätt i normal mukosa i nedre mag-tarmkanalen och i CRC. β-catenin är en intracellulär mediator i Wnt/β-catenin signaleringsvägen, som spelar en viktig roll i kolorektal carcinogenes. Uttryck av SATB1, SATB2 och β-catenin har studerats i tissue microarrays med tumörprover från 270 CRC patienter. Deras inbördes korrelation samt koppling till recidivfri överlevnad har studerats med hjälp av Spearman´s korrelationstest respektive Kaplan-Meier analys och log-rank test. Resultatet från immunhistokemiska färgningar visar att det finns en korrelation mellan de analyserade markörerna. Därutöver fann vi att SATB1 uttryck är kopplat till kortare recidivfri överlevnad i tumörer med lågt SATB2 uttryck.

Examensarbete.pdf (818.3Kb)

Inventering av en ny variant av mecA hos cefoxitin-resistenta Staphyl...
Sundin, Katarina : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2012)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	Methicillin-resistant Staphylococcus aure s (MRSA) has become a more frequent pathogen within health care facilities and the community. MRSA causes infections that can’t be treated with β-lactamantibiotics. To prevent the spread of MRSA, patients and medical personnel undergo screening-tests. In the screening-tests PCR-analysis of mecA, nuc and/or Sa442 is included. MecA is located at Staphylococcal Chromosomal Cassette mec (SCCmec) and is a marker for MRSA, whereas nuc and Sa442 state regular S. Aureus infections. PCR-positive isolates are grown on agar plates after enrichment in selective broth. Colonies of S. aureus are tested for cefoxitin susceptibility to which MRSA is resistant. PCR-analysis of mecA is the reference method that is being used today when MRSA is being diagnosed. During the last decade cefoxitin-resistant strains that lack mecA in the PCR has been reported. In 2011 a new variant of SCCmec and a new variant of mecA, mecALGA251 was reported. In this study a new real-time-PCR has been developed in order to identify mecALGA251. The new PCR protocol was being used to examine 43 clinical isolates, four cefoxitin-susceptible S. aureus from the routine and three reference strains were examined. The clinical isolates had been collected during the period 2004-2011 and were cefoxitin-resistant but lacked mecA. In total of 40 of the 43 cefoxitin-resistant was PCR positive for mecALGA251. Susceptibility testing with disk diffusion and E-test for cefoxitin, oxacillin, cefuroxime and cefotaxime showed that this type of MRSA can’t be distinguished from regular MRSA. The results showed that cefoxitin-resistant S. aureus isolates carrying mecALGA251 exist among patients in Skåne County. One cefoxitin-resistant S. aureus isolate lacked both classic mecA and mecALGA251, which indicates that other mechanisms may exist, however these results has not been further analysed in this study.
Swedish abstract:	Methicillin-resistenta Staphylococcus aureus (MRSA) har blivit en allt vanligare patogen inom sjukvården och i samhället. MRSA orsakar infektioner som inte kan behandlas med β-laktamantibiotika. För att förhindra spridning genomgår patienter och sjukvårdspersonal screening-tester. I dessa screening-tester ingår PCR-analys av mecA, nuc och/eller Sa442. MecA är lokaliserad på Staphylococcal Cromosomal Cassette mec (SCCmec) och används som en markör för MRSA medan nuc och Sa442 anger S. aureus. PCR-positiva isolat odlas ut på agarplattor efter anrikning i en selektiv buljong. Kolonier av S. aureus resistensbestäms mot cefoxitin som MRSA är resistent mot. Idag används dock PCR-analys av mecA som en referensmetod för diagnostisering av MRSA. Under det senaste årtiondet har även rapporterats fynd av stammar som enligt resistensmönster är MRSA men som har utfallit negativt för mecA i PCR. Under 2011 rapporterades en ny variant av SCCmec och en ny variant av mecA, mecALGA251. I denna studie har en realtids-PCR tagits fram för att identifiera den nya varianten, mecALGA251. Denna PCR användes för att undersöka 43 kliniska isolat, fyra cefoxitin-känsliga S. aureus från rutinen och tre referensstammar. De kliniska isolaten hade samlats in under perioden 2004 – 2011 och hade uppvisat cefoxitin-resistens men gett negativt resultat i mecA-PCR. Totalt 40 av de 43 cefoxitin-resistenta kliniska isolaten visades bära mecALGA251. Resistensbestämningar med diskdiffusion och E-test mot cefoxitin, oxacillin, cefuroxim och cefotaxim visade att denna typ av MRSA inte kan skiljas från klassisk MRSA. Resultaten visar att cefoxitin-resistenta S. aureus isolat som bär mecALGA251 finns bland skånska patienter. De visar också att det finns cefoxitin-resistent S. aureus som saknar både klassiska mecA och mecALGA251. Dessa stammar har inte studerats vidare i denna studie.

Examensarbete.pdf (795.5Kb)

Saccharification of lignocellulose
Warsame, Mohamed : Malmö högskola/Hälsa och samhälle (2012)	bachelor STUDENT ESSAY

English abstract:	The increasing energy demand and the anticipated decline in crude oil production has led to an immense search for new energy sources. Plant cell walls contain lignocellulose that conserve great amounts of energy. These polysaccharides are of high importance for the search of renewable energy sources. Pretreatment of the cell wall is necessary in order to hydrolyse it to its component sugars. Once degraded to monomeric sugars it can be fermented to either ethanol or biogas through established fermentation technologies. The aim of this thesis was to compare and evaluate some of the methods used for sacchrification of lignocellulose. Three treatments where compared to determine which is highest yielding. These are enzymatic hydrolysis, microwave irradiation and steam explosion. Wheat straw was used as substrate and hydrolysed by three commercial enzyme mixtures. Samples were pretreated before the enzymatic reaction with either microwave or steam explosion. Results showed that a treatment of either microwave irradiation or steam explosion combined with enzyme hydrolysis gives the highest yield in monomeric sugars. The conclusions that can be drawn are that mechanical pretreatment increases yield drastically but is insufficient in its self. Further enzymatic treatment of wheat straw is necessary to obtain high amounts of simple sugars.
Swedish abstract:	Den ökande efterfrågan på energi och den förväntade nedgången i råoljeproduktion har lett till ett enormt sökande efter nya energikällor. Cellväggen i växter består till stor del av lignocellulosa som i sin tur innehåller cellulosa och hemicellulosa. Dessa polysackarider är av stor betydelse för sökandet efter förnyelsebar energi. Cellväggen måste förbehandlas innan den kan brytas ner till enkla sockerarter. Efter nedbrytning kan monosackariderna användas till produktion av etanol eller biogas genom väl etablerade fermenteringstekniker. Syftet med denna studie var att jämföra och utvärdera några metoder som används vid degradering av lignocellulosa. Tre behandlingar har jämfört för att se vilken som ger mest avkastning i form av monosackarider. Vetehalm användes som substrat och hydrolyseras med hjälp av tre kommersiella enzymblandningar. Proverna förbehandlades före den enzymatiska reaktionen med antingen mikrovågor eller ångexplosion. Resultaten visade att en behandling med mikrovågsbestrålning eller ångexplosion kombinerad med enzymhydrolys gav högst avkastning. De slutsatser som kan dras är att en mekanisk förbehandling ökar utbytet drastiskt men är otillräcklig i sig. Ytterligare enzymatisk behandling är nödvändig att erhålla större mängder enkla sockerarter från lignocellulosa.

Saccharification of lignocellulose.pdf (1.266Mb)

Now showing items 1-15 of 15

Search

Browse

All contents
This Collection
- By Date
- Authors
- Titles
- Subjects

Browsing Student Essays / Biomedicinsk laboratorievetenskap by Issue Date

MUEP

Browsing Student Essays / Biomedicinsk laboratorievetenskap by Issue Date

Search

Browse

All contents

This Collection

My Account